Нежилое помещение (производственно-складское здание), используемое в целях осуществления предпринимательской деятельности, является объектом, относящимся к основным средствам индивидуального предпринимателя, на который предусмотрено начисление амортизации, уменьшающей сумму налогооблагаемых доходов, полученных от осуществления предпринимательской деятельности.

Поэтому при его продаже получить имущественный вычет нельзя - это будет считаться повторным уменьшением налоговой базы по одному и тому же объекту, а такое не предусмотрено Налоговым кодексом. Об этом сказано в письме Минфина России от 18 августа 2008 года № 03-04-05-01/303.